Il a obtenu son diplôme de médecine à l'Université de Montréal et a terminé sa résidence en oto-rhino-laryngologie et chirurgie cervico-faciale dans la même université.
Au Canada, moins de 30 postes sont offerts chaque année dans cette spécialité, ce qui en fait l'une des plus sélectives. Il a terminé ses études parmi les 101 meilleurs diplômés de sa discipline et figurait sur la liste d'honneur du doyen.
Il a également obtenu la bourse de surspécialisation, une récompense prestigieuse décernée chaque année à un seul étudiant parmi 321 diplômés en médecine et en chirurgie.
Il partit ensuite pour New York, à la prestigieuse Icahn School of Medicine du Mont Sinaï, pour travailler sous la direction du Dr Mark Urken, l'un des pères fondateurs de la reconstruction complexe de la tête et du cou.
Il a obtenu son diplôme de spécialisation en reconstruction microvasculaire et oncologie cervico-faciale, accréditée par l'American Head and Neck Society. Lors de ces interventions, qui durent souvent plus de six heures, les chirurgiens prélèvent des tissus sur les bras, le thorax ou les jambes des patients pour reconstruire le visage, et suturent les petits vaisseaux sanguins du cou à l'aide de sutures extrêmement fines.
Il fut alors le premier non-Américain à être admis au programme de chirurgie plastique et reconstructive du visage de la prestigieuse université de Stanford en Californie, souvent classée première au niveau mondial.
Il a passé un an sous la tutelle du Dr Sam Most, l'un des plus grands spécialistes mondiaux de la rhinoplastie et de la chirurgie faciale. Ce programme, parmi les rares au monde à offrir une formation complète en chirurgie esthétique et reconstructive complexe du visage, est accrédité par l'Académie américaine de chirurgie plastique et reconstructive du visage. Il a obtenu son diplôme parmi les 101 meilleurs d'Amérique du Nord lors de l'examen de certification de spécialité.
Il est certifié par le Collège royal des médecins et chirurgiens du Canada et possède un certificat de spécialiste du Collège des médecins du Québec.
Il est également diplômé de l'American Board of Facial Plastic and Reconstructive Surgery (ABFPRS), le plus important organisme de certification au monde en chirurgie plastique et reconstructive du visage. Le Dr Moubayed a obtenu un score parmi les 101 meilleurs à l'examen de l'ABFPRS.

